Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PNMA3Q9UL41 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PNMA3Q9UL41 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PNMA3Q9UL41 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PNMA3Q9UL41 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PNMA3Q9UL41 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PNMA3Q9UL41 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PNMA3Q9UL41 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PNMA3Q9UL41 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PNMA3Q9UL41 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PNMA3Q9UL41 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PNMA3Q9UL41 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PNMA3Q9UL41 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PNMA3Q9UL41 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PNMA3Q9UL41 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms