Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC2LQ9UL33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2LQ9UL33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2LQ9UL33 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms