Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSEQ9UL01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSEQ9UL01 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSEQ9UL01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DSEQ9UL01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSEQ9UL01 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSEQ9UL01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSEQ9UL01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSEQ9UL01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSEQ9UL01 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSEQ9UL01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DSEQ9UL01 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSEQ9UL01 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSEQ9UL01 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSEQ9UL01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms