Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC13A4Q9UKG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC13A4Q9UKG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A4Q9UKG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC13A4Q9UKG4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms