Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBD1Q9UJT1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBD1Q9UJT1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBD1Q9UJT1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBD1Q9UJT1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBD1Q9UJT1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBD1Q9UJT1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBD1Q9UJT1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBD1Q9UJT1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBD1Q9UJT1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBD1Q9UJT1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBD1Q9UJT1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBD1Q9UJT1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms