Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRRDQ9UH36 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRRDQ9UH36 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRRDQ9UH36 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRRDQ9UH36 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRRDQ9UH36 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRRDQ9UH36 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SRRDQ9UH36 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SRRDQ9UH36 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRRDQ9UH36 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRRDQ9UH36 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRRDQ9UH36 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRRDQ9UH36 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRRDQ9UH36 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRRDQ9UH36 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRRDQ9UH36 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRRDQ9UH36 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRRDQ9UH36 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SRRDQ9UH36 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRRDQ9UH36 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRRDQ9UH36 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms