Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNFX1Q9P2E3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNFX1Q9P2E3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZNFX1Q9P2E3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNFX1Q9P2E3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNFX1Q9P2E3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNFX1Q9P2E3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNFX1Q9P2E3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNFX1Q9P2E3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNFX1Q9P2E3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNFX1Q9P2E3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNFX1Q9P2E3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNFX1Q9P2E3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNFX1Q9P2E3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNFX1Q9P2E3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNFX1Q9P2E3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNFX1Q9P2E3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ZNFX1Q9P2E3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNFX1Q9P2E3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNFX1Q9P2E3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNFX1Q9P2E3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNFX1Q9P2E3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNFX1Q9P2E3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNFX1Q9P2E3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNFX1Q9P2E3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNFX1Q9P2E3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNFX1Q9P2E3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms