Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USE1Q9NZ43 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USE1Q9NZ43 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USE1Q9NZ43 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USE1Q9NZ43 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USE1Q9NZ43 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USE1Q9NZ43 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USE1Q9NZ43 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USE1Q9NZ43 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USE1Q9NZ43 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USE1Q9NZ43 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USE1Q9NZ43 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USE1Q9NZ43 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USE1Q9NZ43 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms