Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NMRK1Q9NWW6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NMRK1Q9NWW6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NMRK1Q9NWW6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NMRK1Q9NWW6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NMRK1Q9NWW6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NMRK1Q9NWW6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NMRK1Q9NWW6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NMRK1Q9NWW6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NMRK1Q9NWW6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NMRK1Q9NWW6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NMRK1Q9NWW6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NMRK1Q9NWW6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms