Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIC8BQ9NVN3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIC8BQ9NVN3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIC8BQ9NVN3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RIC8BQ9NVN3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms