Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C19orf12Q9NSK7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C19orf12Q9NSK7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C19orf12Q9NSK7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C19orf12Q9NSK7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms