Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP3Q9NS15 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP3Q9NS15 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP3Q9NS15 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP3Q9NS15 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP3Q9NS15 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LTBP3Q9NS15 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LTBP3Q9NS15 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LTBP3Q9NS15 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LTBP3Q9NS15 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LTBP3Q9NS15 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LTBP3Q9NS15 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LTBP3Q9NS15 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTBP3Q9NS15 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTBP3Q9NS15 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTBP3Q9NS15 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LTBP3Q9NS15 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LTBP3Q9NS15 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LTBP3Q9NS15 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
LTBP3Q9NS15 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTBP3Q9NS15 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTBP3Q9NS15 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTBP3Q9NS15 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LTBP3Q9NS15 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LTBP3Q9NS15 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms