Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CD163L1Q9NR16 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CD163L1Q9NR16 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CD163L1Q9NR16 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CD163L1Q9NR16 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CD163L1Q9NR16 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CD163L1Q9NR16 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CD163L1Q9NR16 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CD163L1Q9NR16 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CD163L1Q9NR16 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CD163L1Q9NR16 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CD163L1Q9NR16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CD163L1Q9NR16 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CD163L1Q9NR16 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CD163L1Q9NR16 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CD163L1Q9NR16 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD163L1Q9NR16 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CD163L1Q9NR16 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CD163L1Q9NR16 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms