Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
XPNPEP3Q9NQH7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPNPEP3Q9NQH7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPNPEP3Q9NQH7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XPNPEP3Q9NQH7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
XPNPEP3Q9NQH7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
XPNPEP3Q9NQH7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
XPNPEP3Q9NQH7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
XPNPEP3Q9NQH7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPNPEP3Q9NQH7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
XPNPEP3Q9NQH7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
XPNPEP3Q9NQH7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
XPNPEP3Q9NQH7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPNPEP3Q9NQH7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPNPEP3Q9NQH7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPNPEP3Q9NQH7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XPNPEP3Q9NQH7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPNPEP3Q9NQH7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPNPEP3Q9NQH7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms