Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1BQ9NQG5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1BQ9NQG5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPRD1BQ9NQG5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPRD1BQ9NQG5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRD1BQ9NQG5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms