Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC1

JADE2, E3 ubiquitin-protein ligase Jade-2, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JADE2Q9NQC1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
JADE2Q9NQC1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
JADE2Q9NQC1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
JADE2Q9NQC1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
JADE2Q9NQC1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
JADE2Q9NQC1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
JADE2Q9NQC1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
JADE2Q9NQC1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
JADE2Q9NQC1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
JADE2Q9NQC1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
JADE2Q9NQC1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
JADE2Q9NQC1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
JADE2Q9NQC1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
JADE2Q9NQC1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
JADE2Q9NQC1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
JADE2Q9NQC1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
JADE2Q9NQC1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
JADE2Q9NQC1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
JADE2Q9NQC1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
JADE2Q9NQC1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
JADE2Q9NQC1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
JADE2Q9NQC1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
JADE2Q9NQC1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
JADE2Q9NQC1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
JADE2Q9NQC1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
JADE2Q9NQC1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
JADE2Q9NQC1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
JADE2Q9NQC1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.1 ms