Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRCC1Q9NPI7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRCC1Q9NPI7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRCC1Q9NPI7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRCC1Q9NPI7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRCC1Q9NPI7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms