Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRD7Q9NPI1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD7Q9NPI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD7Q9NPI1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD7Q9NPI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms