Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREM1Q9NP99 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TREM1Q9NP99 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREM1Q9NP99 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREM1Q9NP99 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TREM1Q9NP99 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TREM1Q9NP99 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TREM1Q9NP99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREM1Q9NP99 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms