Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALMDQ9NP74 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALMDQ9NP74 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALMDQ9NP74 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALMDQ9NP74 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALMDQ9NP74 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALMDQ9NP74 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALMDQ9NP74 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALMDQ9NP74 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALMDQ9NP74 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PALMDQ9NP74 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALMDQ9NP74 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALMDQ9NP74 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms