Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLK4Q9HAZ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK4Q9HAZ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK4Q9HAZ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLK4Q9HAZ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms