Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR41Q9HAD4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
WDR41Q9HAD4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR41Q9HAD4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR41Q9HAD4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR41Q9HAD4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR41Q9HAD4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR41Q9HAD4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR41Q9HAD4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms