Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPF2Q9H7B2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPF2Q9H7B2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPF2Q9H7B2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPF2Q9H7B2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPF2Q9H7B2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPF2Q9H7B2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms