Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIOBPQ9H2D6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIOBPQ9H2D6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIOBPQ9H2D6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIOBPQ9H2D6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIOBPQ9H2D6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIOBPQ9H2D6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIOBPQ9H2D6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIOBPQ9H2D6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIOBPQ9H2D6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIOBPQ9H2D6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIOBPQ9H2D6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIOBPQ9H2D6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIOBPQ9H2D6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIOBPQ9H2D6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIOBPQ9H2D6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIOBPQ9H2D6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIOBPQ9H2D6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIOBPQ9H2D6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms