Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSP1Q9GZU7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSP1Q9GZU7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP1Q9GZU7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP1Q9GZU7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms