Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B3GNT4Q9C0J1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B3GNT4Q9C0J1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B3GNT4Q9C0J1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B3GNT4Q9C0J1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B3GNT4Q9C0J1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms