Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INO80BQ9C086 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
INO80BQ9C086 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INO80BQ9C086 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
INO80BQ9C086 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INO80BQ9C086 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INO80BQ9C086 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INO80BQ9C086 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INO80BQ9C086 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INO80BQ9C086 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
INO80BQ9C086 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
INO80BQ9C086 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80BQ9C086 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
INO80BQ9C086 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80BQ9C086 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80BQ9C086 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80BQ9C086 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80BQ9C086 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80BQ9C086 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80BQ9C086 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80BQ9C086 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
INO80BQ9C086 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80BQ9C086 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms