Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR2

KRTAP4-5, Keratin-associated protein 4-5, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-5Q9BYR2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRTAP4-5Q9BYR2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP4-5Q9BYR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP4-5Q9BYR2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms