Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDCA4Q9BXL8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA4Q9BXL8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA4Q9BXL8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA4Q9BXL8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA4Q9BXL8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA4Q9BXL8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA4Q9BXL8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA4Q9BXL8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA4Q9BXL8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA4Q9BXL8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDCA4Q9BXL8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA4Q9BXL8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCA4Q9BXL8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms