Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPPD1Q9BV87 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPPD1Q9BV87 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNPPD1Q9BV87 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPPD1Q9BV87 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPPD1Q9BV87 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPPD1Q9BV87 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPPD1Q9BV87 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms