Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX7Q9BT81 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX7Q9BT81 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX7Q9BT81 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX7Q9BT81 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms