Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX1AQ9BQ83 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX1AQ9BQ83 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX1AQ9BQ83 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms