Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT1Q99946 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT1Q99946 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRT1Q99946 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT1Q99946 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms