Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6BQ99941 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF6BQ99941 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF6BQ99941 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF6BQ99941 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms