Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOTCH4Q99466 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOTCH4Q99466 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
NOTCH4Q99466 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOTCH4Q99466 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOTCH4Q99466 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms