Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NODALQ96S42 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NODALQ96S42 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NODALQ96S42 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NODALQ96S42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms