Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSNARE1Q96NA8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TSNARE1Q96NA8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSNARE1Q96NA8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1Q96NA8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1Q96NA8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms