Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN6

MBD6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD6Q96DN6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD6Q96DN6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD6Q96DN6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD6Q96DN6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD6Q96DN6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD6Q96DN6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms