Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARVELD3Q96A59 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARVELD3Q96A59 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARVELD3Q96A59 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARVELD3Q96A59 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms