Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NXPE3Q969Y0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NXPE3Q969Y0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NXPE3Q969Y0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NXPE3Q969Y0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NXPE3Q969Y0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NXPE3Q969Y0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NXPE3Q969Y0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NXPE3Q969Y0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NXPE3Q969Y0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NXPE3Q969Y0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NXPE3Q969Y0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NXPE3Q969Y0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NXPE3Q969Y0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NXPE3Q969Y0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms