Protein–RNA interactions for Protein: Q969X5

ERGIC1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC1Q969X5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERGIC1Q969X5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERGIC1Q969X5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERGIC1Q969X5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERGIC1Q969X5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms