Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX4Q969G2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX4Q969G2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX4Q969G2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX4Q969G2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX4Q969G2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms