Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNRQ92752 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNRQ92752 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNRQ92752 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNRQ92752 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNRQ92752 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNRQ92752 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNRQ92752 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNRQ92752 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNRQ92752 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TNRQ92752 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TNRQ92752 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TNRQ92752 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TNRQ92752 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TNRQ92752 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
TNRQ92752 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TNRQ92752 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TNRQ92752 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TNRQ92752 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TNRQ92752 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TNRQ92752 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TNRQ92752 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TNRQ92752 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TNRQ92752 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TNRQ92752 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TNRQ92752 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TNRQ92752 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TNRQ92752 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TNRQ92752 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TNRQ92752 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TNRQ92752 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TNRQ92752 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
TNRQ92752 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TNRQ92752 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TNRQ92752 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TNRQ92752 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TNRQ92752 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TNRQ92752 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TNRQ92752 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TNRQ92752 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TNRQ92752 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TNRQ92752 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TNRQ92752 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
TNRQ92752 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TNRQ92752 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TNRQ92752 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TNRQ92752 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TNRQ92752 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TNRQ92752 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TNRQ92752 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TNRQ92752 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TNRQ92752 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TNRQ92752 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TNRQ92752 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.79
TNRQ92752 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
TNRQ92752 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
TNRQ92752 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TNRQ92752 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TNRQ92752 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TNRQ92752 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TNRQ92752 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TNRQ92752 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TNRQ92752 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TNRQ92752 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TNRQ92752 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TNRQ92752 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TNRQ92752 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TNRQ92752 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TNRQ92752 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
TNRQ92752 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TNRQ92752 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TNRQ92752 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TNRQ92752 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TNRQ92752 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TNRQ92752 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TNRQ92752 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TNRQ92752 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TNRQ92752 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
TNRQ92752 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TNRQ92752 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TNRQ92752 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TNRQ92752 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TNRQ92752 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TNRQ92752 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TNRQ92752 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TNRQ92752 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TNRQ92752 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TNRQ92752 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TNRQ92752 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TNRQ92752 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TNRQ92752 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TNRQ92752 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TNRQ92752 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TNRQ92752 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TNRQ92752 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TNRQ92752 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TNRQ92752 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TNRQ92752 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TNRQ92752 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
TNRQ92752 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms