Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.38■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
TRIM41Q8WV44 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
TRIM41Q8WV44 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
TRIM41Q8WV44 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
TRIM41Q8WV44 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
TRIM41Q8WV44 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
TRIM41Q8WV44 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
TRIM41Q8WV44 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
TRIM41Q8WV44 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC45.25■■■■■ 4.83
TRIM41Q8WV44 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
TRIM41Q8WV44 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
TRIM41Q8WV44 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
TRIM41Q8WV44 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
TRIM41Q8WV44 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
TRIM41Q8WV44 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
TRIM41Q8WV44 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
TRIM41Q8WV44 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
TRIM41Q8WV44 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
TRIM41Q8WV44 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
TRIM41Q8WV44 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
TRIM41Q8WV44 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
TRIM41Q8WV44 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
TRIM41Q8WV44 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC45.17■■■■■ 4.82
TRIM41Q8WV44 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
TRIM41Q8WV44 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC45.14■■■■■ 4.82
TRIM41Q8WV44 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
TRIM41Q8WV44 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC45.13■■■■■ 4.82
TRIM41Q8WV44 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
TRIM41Q8WV44 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC45.04■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
TRIM41Q8WV44 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC44.98■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
TRIM41Q8WV44 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC44.94■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
TRIM41Q8WV44 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms