Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
DDX54Q8TDD1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
DDX54Q8TDD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
DDX54Q8TDD1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
DDX54Q8TDD1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
DDX54Q8TDD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
DDX54Q8TDD1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
DDX54Q8TDD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
DDX54Q8TDD1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
DDX54Q8TDD1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
DDX54Q8TDD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
DDX54Q8TDD1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
DDX54Q8TDD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
DDX54Q8TDD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
DDX54Q8TDD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
DDX54Q8TDD1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DDX54Q8TDD1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
DDX54Q8TDD1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
DDX54Q8TDD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
DDX54Q8TDD1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
DDX54Q8TDD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
DDX54Q8TDD1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
DDX54Q8TDD1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
DDX54Q8TDD1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
DDX54Q8TDD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
DDX54Q8TDD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
DDX54Q8TDD1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms