Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF398Q8TD17 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF398Q8TD17 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF398Q8TD17 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF398Q8TD17 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms