Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPPL3Q8TCT6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPPL3Q8TCT6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPPL3Q8TCT6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPPL3Q8TCT6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPPL3Q8TCT6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPPL3Q8TCT6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPPL3Q8TCT6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPPL3Q8TCT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPPL3Q8TCT6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SPPL3Q8TCT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms