Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APPL2Q8NEU8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APPL2Q8NEU8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
APPL2Q8NEU8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APPL2Q8NEU8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APPL2Q8NEU8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
APPL2Q8NEU8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms