Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC42

RNF149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF149Q8NC42 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF149Q8NC42 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF149Q8NC42 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF149Q8NC42 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF149Q8NC42 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF149Q8NC42 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF149Q8NC42 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF149Q8NC42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF149Q8NC42 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF149Q8NC42 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF149Q8NC42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF149Q8NC42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF149Q8NC42 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF149Q8NC42 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF149Q8NC42 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF149Q8NC42 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF149Q8NC42 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF149Q8NC42 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF149Q8NC42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF149Q8NC42 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF149Q8NC42 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF149Q8NC42 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF149Q8NC42 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF149Q8NC42 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF149Q8NC42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF149Q8NC42 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF149Q8NC42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF149Q8NC42 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms