Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM99Q8N816 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM99Q8N816 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM99Q8N816 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM99Q8N816 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms